Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID5AQ03989 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID5AQ03989 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID5AQ03989 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID5AQ03989 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID5AQ03989 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID5AQ03989 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID5AQ03989 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID5AQ03989 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID5AQ03989 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms