Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddr1Q03146 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddr1Q03146 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddr1Q03146 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddr1Q03146 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddr1Q03146 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddr1Q03146 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddr1Q03146 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddr1Q03146 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddr1Q03146 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddr1Q03146 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddr1Q03146 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddr1Q03146 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddr1Q03146 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddr1Q03146 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddr1Q03146 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddr1Q03146 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddr1Q03146 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddr1Q03146 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ddr1Q03146 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddr1Q03146 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddr1Q03146 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddr1Q03146 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddr1Q03146 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddr1Q03146 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddr1Q03146 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddr1Q03146 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddr1Q03146 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddr1Q03146 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddr1Q03146 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddr1Q03146 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 349.6 ms