Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 MAE1YKL029C 2010 nt9.58□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 COG1YGL223C 1254 nt9.58□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 CWP2YKL096W-A 279 nt9.58□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 URH1YDR400W 1023 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 LCP5YER127W 1074 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 YKR012CYKR012C 378 nt9.57□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 ADH3YMR083W 1128 nt9.56□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 IPL1YPL209C 1104 nt9.56□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 GNP1YDR508C 1992 nt9.55□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 PHB2YGR231C 933 nt9.54□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 YMR209CYMR209C 1374 nt9.53□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 YCR025CYCR025C 411 nt9.53□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 MOB1YIL106W 945 nt9.53□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 REX2YLR059C 810 nt9.53□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 RPC31YNL151C 756 nt9.53□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 RIM2YBR192W 1134 nt9.53□□□□□ -0.88
GDE1Q02979 KRR1YCL059C 951 nt9.52□□□□□ -0.89
GDE1Q02979 FLX1YIL134W 936 nt9.52□□□□□ -0.89
GDE1Q02979 SRP54YPR088C 1626 nt9.52□□□□□ -0.89
GDE1Q02979 ACO2YJL200C 2370 nt9.5□□□□□ -0.89
GDE1Q02979 KGD2YDR148C 1392 nt9.5□□□□□ -0.89
GDE1Q02979 SDS24YBR214W 1584 nt9.49□□□□□ -0.89
GDE1Q02979 SAN1YDR143C 1833 nt9.49□□□□□ -0.89
GDE1Q02979 MDM35YKL053C-A 261 nt9.48□□□□□ -0.89
GDE1Q02979 FTH1YBR207W 1398 nt9.47□□□□□ -0.89
GDE1Q02979 SAM50YNL026W 1455 nt9.47□□□□□ -0.89
GDE1Q02979 SOD2YHR008C 702 nt9.45□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 ERG6YML008C 1152 nt9.45□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 RIB1YBL033C 1038 nt9.45□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 ENO1YGR254W 1314 nt9.45□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 DPL1YDR294C 1770 nt9.45□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 CYC3YAL039C 810 nt9.44□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 DMA2YNL116W 1569 nt9.44□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 VBA3YCL069W 1377 nt9.43□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 SBP1YHL034C 885 nt9.43□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 YCP4YCR004C 744 nt9.42□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 LYS20YDL182W 1287 nt9.42□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 YIA6YIL006W 1122 nt9.42□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 YPT11YNL304W 1254 nt9.42□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 YLR122CYLR122C 378 nt9.41□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 AI5_BETAQ0075 1065 nt9.4□□□□□ -0.9
GDE1Q02979 GAS1YMR307W 1680 nt9.39□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 PTC6YCR079W 1329 nt9.39□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 YLR173WYLR173W 1827 nt9.38□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 YDR467CYDR467C 327 nt9.37□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 SER2YGR208W 930 nt9.37□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 YLR280CYLR280C 351 nt9.37□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 LEU4YNL104C 1860 nt9.36□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 FAF1YIL019W 1041 nt9.36□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 SRP102YKL154W 735 nt9.36□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 REG2YBR050C 1017 nt9.36□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 YTH1YPR107C 627 nt9.36□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 GGA2YHR108W 1758 nt9.35□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 ARA2YMR041C 1008 nt9.35□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 PSD1YNL169C 1503 nt9.35□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 CYT1YOR065W 930 nt9.34□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 HTS1YPR033C 1641 nt9.34□□□□□ -0.91
GDE1Q02979 ERO1YML130C 1692 nt9.33□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 TOM20YGR082W 552 nt9.33□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 RSM7YJR113C 744 nt9.33□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 GPM1YKL152C 744 nt9.33□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 NSG2YNL156C 900 nt9.33□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 HXT10YFL011W 1641 nt9.33□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 YFR020WYFR020W 699 nt9.32□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 THI3YDL080C 1830 nt9.31□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 INH1YDL181W 258 nt9.31□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 SWM1YDR260C 513 nt9.31□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.3□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.3□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.3□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.3□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.3□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.3□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.28□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.28□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 YGR210CYGR210C 1236 nt9.28□□□□□ -0.92
GDE1Q02979 YHR218WYHR218W 1812 nt9.27□□□□□ -0.93
GDE1Q02979 PUS5YLR165C 765 nt9.27□□□□□ -0.93
GDE1Q02979 YBL095WYBL095W 813 nt9.26□□□□□ -0.93
GDE1Q02979 FCY1YPR062W 477 nt9.26□□□□□ -0.93
GDE1Q02979 AGP3YFL055W 1677 nt9.26□□□□□ -0.93
GDE1Q02979 YMC2YBR104W 990 nt9.24□□□□□ -0.93
GDE1Q02979 YRF1-2YER190W 5046 nt9.23□□□□□ -0.93
GDE1Q02979 YER152W-AYER152W-A 567 nt9.23□□□□□ -0.93
GDE1Q02979 FHN1YGR131W 525 nt9.23□□□□□ -0.93
GDE1Q02979 YMR007WYMR007W 381 nt9.23□□□□□ -0.93
GDE1Q02979 NPP2YEL016C 1482 nt9.22□□□□□ -0.93
GDE1Q02979 YLR460CYLR460C 1131 nt9.22□□□□□ -0.93
GDE1Q02979 TOM71YHR117W 1920 nt9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32 ms