Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PLOD1Q02809 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PLOD1Q02809 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLOD1Q02809 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms