Protein–RNA interactions for Protein: Q02630

NUP116, Nucleoporin NUP116/NSP116, yeastyeast

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP116Q02630 YIA6YIL006W 1122 nt7.77□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 ELO1YJL196C 933 nt7.77□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 TAF13YML098W 504 nt7.77□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 YNR064CYNR064C 873 nt7.77□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 MHF1YOL086W-A 273 nt7.77□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 TRP2YER090W 1524 nt7.77□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 CTI6YPL181W 1521 nt7.77□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 TVP23YDR084C 600 nt7.76□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 PAU5YFL020C 369 nt7.76□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 SPS100YHR139C 981 nt7.76□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 HAP5YOR358W 729 nt7.76□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 MTO1YGL236C 2010 nt7.75□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.75□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 SOD2YHR008C 702 nt7.75□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 THI6YPL214C 1623 nt7.74□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 TOM71YHR117W 1920 nt7.74□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 OPI3YJR073C 621 nt7.74□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 snR4snR4 186 nt7.74□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 FIT1YDR534C 1587 nt7.74□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 YBL095WYBL095W 813 nt7.73□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 YLR173WYLR173W 1827 nt7.73□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 DUR3YHL016C 2208 nt7.72□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 KEL3YPL263C 1956 nt7.72□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 HXT11YOL156W 1704 nt7.72□□□□□ -1.17
NUP116Q02630 TPN1YGL186C 1740 nt7.71□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 POT1YIL160C 1254 nt7.7□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 EMC3YKL207W 762 nt7.7□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 ABZ2YMR289W 1125 nt7.7□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 POP2YNR052C 1302 nt7.7□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 AAT1YKL106W 1356 nt7.7□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 GPM1YKL152C 744 nt7.69□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 YMC2YBR104W 990 nt7.69□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 snR31snR31 225 nt7.68□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 ADE16YLR028C 1776 nt7.68□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 YDR306CYDR306C 1437 nt7.68□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 DUS3YLR401C 2007 nt7.68□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 SUV3YPL029W 2214 nt7.67□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 SRM1YGL097W 1449 nt7.65□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 AMF1YOR378W 1548 nt7.65□□□□□ -1.18
NUP116Q02630 ENO2YHR174W 1314 nt7.64□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 GSF2YML048W 1212 nt7.64□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 SWT21YNL187W 1074 nt7.63□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 CRC1YOR100C 984 nt7.63□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 RTG2YGL252C 1767 nt7.63□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 LPD1YFL018C 1500 nt7.62□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.62□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.62□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.62□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 YMR210WYMR210W 1350 nt7.62□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.62□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 SFL1YOR140W 2301 nt7.61□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 YIL177CYIL177C 5277 nt7.61□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 TUB4YLR212C 1422 nt7.61□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 FTH1YBR207W 1398 nt7.6□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 MET1YKR069W 1782 nt7.6□□□□□ -1.19
NUP116Q02630 DIA4YHR011W 1341 nt7.58□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 GGA2YHR108W 1758 nt7.58□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 PFS2YNL317W 1398 nt7.58□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 NIF3YGL221C 867 nt7.57□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 MRS4YKR052C 915 nt7.57□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 LEU2YCL018W 1095 nt7.57□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 HSV2YGR223C 1347 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 PAR32YDL173W 888 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 PUS7YOR243C 2031 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 TPC1YGR096W 945 nt7.55□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 KGD2YDR148C 1392 nt7.55□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 THI3YDL080C 1830 nt7.55□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 APS2YJR058C 444 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 BUD20YLR074C 501 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 KRE1YNL322C 942 nt7.53□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 MDH2YOL126C 1134 nt7.53□□□□□ -1.2
NUP116Q02630 YCP4YCR004C 744 nt7.52□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 YKL053WYKL053W 375 nt7.52□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 FSH2YMR222C 672 nt7.52□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 LEA1YPL213W 717 nt7.52□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.51□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.51□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.51□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 ADE2YOR128C 1716 nt7.51□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 SNU66YOR308C 1764 nt7.51□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 NAM8YHR086W 1572 nt7.5□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 YLR072WYLR072W 2082 nt7.5□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 SBP1YHL034C 885 nt7.5□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 THP3YPR045C 1413 nt7.5□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 MET30YIL046W 1923 nt7.5□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 SAN1YDR143C 1833 nt7.5□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 SRP54YPR088C 1626 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 SLM3YDL033C 1254 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 snR86snR86 1004 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 SPE2YOL052C 1191 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 ALR1YOL130W 2580 nt7.48□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 REX2YLR059C 810 nt7.48□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 TOS1YBR162C 1368 nt7.47□□□□□ -1.21
NUP116Q02630 YNL190WYNL190W 615 nt7.46□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 NAS2YIL007C 663 nt7.45□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 YPT11YNL304W 1254 nt7.45□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 GCD11YER025W 1584 nt7.44□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 HIS3YOR202W 663 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 AAC3YBR085W 924 nt7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.5 ms