Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL18AQ02543 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL18AQ02543 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL18AQ02543 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL18AQ02543 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL18AQ02543 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL18AQ02543 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL18AQ02543 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL18AQ02543 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL18AQ02543 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL18AQ02543 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms