Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OC90Q02509 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OC90Q02509 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OC90Q02509 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OC90Q02509 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OC90Q02509 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OC90Q02509 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OC90Q02509 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OC90Q02509 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OC90Q02509 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OC90Q02509 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OC90Q02509 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OC90Q02509 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OC90Q02509 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OC90Q02509 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OC90Q02509 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OC90Q02509 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OC90Q02509 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OC90Q02509 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OC90Q02509 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OC90Q02509 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OC90Q02509 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OC90Q02509 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OC90Q02509 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OC90Q02509 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OC90Q02509 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OC90Q02509 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OC90Q02509 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OC90Q02509 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OC90Q02509 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OC90Q02509 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OC90Q02509 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OC90Q02509 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OC90Q02509 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OC90Q02509 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OC90Q02509 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OC90Q02509 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OC90Q02509 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
OC90Q02509 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OC90Q02509 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OC90Q02509 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OC90Q02509 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OC90Q02509 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OC90Q02509 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OC90Q02509 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OC90Q02509 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OC90Q02509 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OC90Q02509 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OC90Q02509 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OC90Q02509 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OC90Q02509 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OC90Q02509 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OC90Q02509 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OC90Q02509 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OC90Q02509 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OC90Q02509 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OC90Q02509 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OC90Q02509 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OC90Q02509 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OC90Q02509 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OC90Q02509 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
OC90Q02509 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OC90Q02509 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OC90Q02509 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OC90Q02509 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OC90Q02509 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OC90Q02509 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
OC90Q02509 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OC90Q02509 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OC90Q02509 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OC90Q02509 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OC90Q02509 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OC90Q02509 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OC90Q02509 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OC90Q02509 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OC90Q02509 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
OC90Q02509 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OC90Q02509 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OC90Q02509 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OC90Q02509 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OC90Q02509 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OC90Q02509 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OC90Q02509 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OC90Q02509 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OC90Q02509 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OC90Q02509 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OC90Q02509 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OC90Q02509 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OC90Q02509 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OC90Q02509 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OC90Q02509 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OC90Q02509 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OC90Q02509 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OC90Q02509 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OC90Q02509 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OC90Q02509 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OC90Q02509 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OC90Q02509 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OC90Q02509 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OC90Q02509 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms