Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SP3Q02447 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SP3Q02447 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SP3Q02447 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SP3Q02447 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SP3Q02447 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SP3Q02447 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SP3Q02447 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SP3Q02447 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SP3Q02447 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SP3Q02447 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SP3Q02447 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SP3Q02447 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SP3Q02447 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SP3Q02447 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SP3Q02447 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SP3Q02447 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SP3Q02447 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SP3Q02447 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SP3Q02447 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SP3Q02447 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SP3Q02447 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SP3Q02447 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SP3Q02447 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SP3Q02447 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SP3Q02447 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SP3Q02447 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SP3Q02447 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SP3Q02447 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SP3Q02447 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SP3Q02447 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SP3Q02447 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SP3Q02447 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SP3Q02447 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SP3Q02447 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SP3Q02447 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SP3Q02447 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SP3Q02447 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SP3Q02447 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SP3Q02447 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SP3Q02447 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SP3Q02447 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SP3Q02447 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SP3Q02447 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SP3Q02447 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SP3Q02447 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SP3Q02447 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SP3Q02447 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SP3Q02447 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SP3Q02447 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SP3Q02447 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SP3Q02447 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SP3Q02447 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SP3Q02447 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SP3Q02447 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SP3Q02447 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SP3Q02447 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SP3Q02447 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SP3Q02447 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SP3Q02447 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SP3Q02447 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SP3Q02447 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SP3Q02447 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SP3Q02447 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SP3Q02447 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SP3Q02447 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SP3Q02447 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SP3Q02447 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SP3Q02447 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SP3Q02447 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SP3Q02447 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SP3Q02447 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SP3Q02447 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SP3Q02447 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SP3Q02447 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SP3Q02447 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SP3Q02447 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SP3Q02447 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SP3Q02447 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SP3Q02447 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SP3Q02447 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SP3Q02447 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SP3Q02447 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SP3Q02447 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SP3Q02447 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SP3Q02447 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SP3Q02447 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SP3Q02447 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SP3Q02447 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SP3Q02447 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SP3Q02447 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SP3Q02447 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SP3Q02447 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SP3Q02447 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SP3Q02447 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SP3Q02447 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SP3Q02447 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SP3Q02447 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SP3Q02447 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SP3Q02447 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms