Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA1Q02410 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA1Q02410 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
APBA1Q02410 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBA1Q02410 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms