Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHDQ02161 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHDQ02161 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHDQ02161 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHDQ02161 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHDQ02161 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHDQ02161 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHDQ02161 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHDQ02161 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHDQ02161 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHDQ02161 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHDQ02161 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHDQ02161 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHDQ02161 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RHDQ02161 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RHDQ02161 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RHDQ02161 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHDQ02161 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHDQ02161 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHDQ02161 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHDQ02161 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHDQ02161 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHDQ02161 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHDQ02161 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHDQ02161 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHDQ02161 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHDQ02161 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHDQ02161 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RHDQ02161 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHDQ02161 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHDQ02161 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHDQ02161 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHDQ02161 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHDQ02161 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHDQ02161 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHDQ02161 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHDQ02161 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RHDQ02161 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHDQ02161 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHDQ02161 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHDQ02161 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RHDQ02161 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHDQ02161 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHDQ02161 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHDQ02161 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHDQ02161 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHDQ02161 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHDQ02161 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHDQ02161 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHDQ02161 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHDQ02161 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHDQ02161 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHDQ02161 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHDQ02161 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHDQ02161 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHDQ02161 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHDQ02161 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHDQ02161 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHDQ02161 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHDQ02161 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHDQ02161 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RHDQ02161 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RHDQ02161 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RHDQ02161 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHDQ02161 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHDQ02161 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHDQ02161 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHDQ02161 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHDQ02161 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RHDQ02161 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHDQ02161 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHDQ02161 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHDQ02161 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RHDQ02161 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHDQ02161 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHDQ02161 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHDQ02161 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHDQ02161 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RHDQ02161 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHDQ02161 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHDQ02161 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHDQ02161 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHDQ02161 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHDQ02161 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHDQ02161 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RHDQ02161 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHDQ02161 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHDQ02161 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHDQ02161 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHDQ02161 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHDQ02161 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHDQ02161 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHDQ02161 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHDQ02161 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHDQ02161 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHDQ02161 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHDQ02161 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHDQ02161 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHDQ02161 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHDQ02161 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms