Protein–RNA interactions for Protein: Q01432

AMPD3, AMP deaminase 3, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD3Q01432 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
AMPD3Q01432 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AMPD3Q01432 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AMPD3Q01432 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPD3Q01432 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AMPD3Q01432 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AMPD3Q01432 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AMPD3Q01432 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AMPD3Q01432 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AMPD3Q01432 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AMPD3Q01432 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AMPD3Q01432 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AMPD3Q01432 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AMPD3Q01432 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AMPD3Q01432 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AMPD3Q01432 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms