Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col8a1Q00780 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col8a1Q00780 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col8a1Q00780 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Col8a1Q00780 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col8a1Q00780 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms