Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apoa1Q00623 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Apoa1Q00623 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apoa1Q00623 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apoa1Q00623 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apoa1Q00623 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apoa1Q00623 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apoa1Q00623 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apoa1Q00623 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apoa1Q00623 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apoa1Q00623 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apoa1Q00623 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apoa1Q00623 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apoa1Q00623 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apoa1Q00623 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa1Q00623 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa1Q00623 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms