Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDPQ00604 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDPQ00604 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDPQ00604 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDPQ00604 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDPQ00604 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDPQ00604 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDPQ00604 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDPQ00604 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDPQ00604 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDPQ00604 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NDPQ00604 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDPQ00604 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDPQ00604 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDPQ00604 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NDPQ00604 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDPQ00604 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDPQ00604 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDPQ00604 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDPQ00604 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDPQ00604 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDPQ00604 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDPQ00604 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDPQ00604 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDPQ00604 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDPQ00604 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDPQ00604 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDPQ00604 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDPQ00604 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDPQ00604 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDPQ00604 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDPQ00604 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDPQ00604 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDPQ00604 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDPQ00604 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDPQ00604 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDPQ00604 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDPQ00604 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDPQ00604 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDPQ00604 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDPQ00604 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDPQ00604 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDPQ00604 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDPQ00604 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDPQ00604 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDPQ00604 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDPQ00604 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDPQ00604 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDPQ00604 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDPQ00604 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDPQ00604 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDPQ00604 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDPQ00604 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDPQ00604 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDPQ00604 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDPQ00604 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDPQ00604 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDPQ00604 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDPQ00604 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDPQ00604 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDPQ00604 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDPQ00604 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDPQ00604 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDPQ00604 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NDPQ00604 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDPQ00604 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDPQ00604 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDPQ00604 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDPQ00604 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDPQ00604 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDPQ00604 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDPQ00604 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDPQ00604 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDPQ00604 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDPQ00604 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDPQ00604 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDPQ00604 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDPQ00604 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NDPQ00604 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NDPQ00604 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NDPQ00604 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDPQ00604 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDPQ00604 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDPQ00604 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDPQ00604 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDPQ00604 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDPQ00604 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDPQ00604 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDPQ00604 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDPQ00604 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDPQ00604 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NDPQ00604 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NDPQ00604 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDPQ00604 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDPQ00604 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDPQ00604 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDPQ00604 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDPQ00604 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDPQ00604 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDPQ00604 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms