Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC42EP1Q00587 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC42EP1Q00587 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC42EP1Q00587 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC42EP1Q00587 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC42EP1Q00587 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC42EP1Q00587 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC42EP1Q00587 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC42EP1Q00587 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC42EP1Q00587 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC42EP1Q00587 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC42EP1Q00587 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC42EP1Q00587 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC42EP1Q00587 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC42EP1Q00587 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC42EP1Q00587 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC42EP1Q00587 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC42EP1Q00587 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC42EP1Q00587 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms