Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC5Q00444 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC5Q00444 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXC5Q00444 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC5Q00444 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms