Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcf7Q00417 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcf7Q00417 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf7Q00417 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcf7Q00417 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms