Protein–RNA interactions for Protein: P99024

Tubb5, Tubulin beta-5 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb5P99024 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb5P99024 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb5P99024 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb5P99024 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb5P99024 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb5P99024 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb5P99024 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb5P99024 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb5P99024 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb5P99024 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb5P99024 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb5P99024 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb5P99024 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb5P99024 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb5P99024 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb5P99024 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb5P99024 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb5P99024 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb5P99024 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb5P99024 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tubb5P99024 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb5P99024 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb5P99024 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms