Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP11AP98196 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP11AP98196 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11AP98196 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11AP98196 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11AP98196 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11AP98196 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP11AP98196 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP11AP98196 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11AP98196 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11AP98196 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11AP98196 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11AP98196 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP11AP98196 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP11AP98196 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP11AP98196 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP11AP98196 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP11AP98196 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP11AP98196 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP11AP98196 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP11AP98196 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP11AP98196 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP11AP98196 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP11AP98196 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP11AP98196 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP11AP98196 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP11AP98196 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP11AP98196 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP11AP98196 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP11AP98196 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP11AP98196 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP11AP98196 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP11AP98196 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP11AP98196 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms