Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shc1P98083 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shc1P98083 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shc1P98083 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shc1P98083 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shc1P98083 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shc1P98083 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Shc1P98083 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shc1P98083 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shc1P98083 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shc1P98083 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Shc1P98083 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shc1P98083 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shc1P98083 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shc1P98083 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shc1P98083 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shc1P98083 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Shc1P98083 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shc1P98083 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shc1P98083 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shc1P98083 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shc1P98083 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shc1P98083 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shc1P98083 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shc1P98083 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shc1P98083 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shc1P98083 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shc1P98083 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Shc1P98083 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shc1P98083 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shc1P98083 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shc1P98083 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shc1P98083 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Shc1P98083 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shc1P98083 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Shc1P98083 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shc1P98083 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shc1P98083 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shc1P98083 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shc1P98083 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shc1P98083 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shc1P98083 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shc1P98083 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms