Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps45P97390 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps45P97390 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps45P97390 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps45P97390 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps45P97390 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps45P97390 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps45P97390 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps45P97390 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps45P97390 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps45P97390 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps45P97390 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps45P97390 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps45P97390 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps45P97390 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps45P97390 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps45P97390 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps45P97390 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps45P97390 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps45P97390 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps45P97390 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps45P97390 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps45P97390 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps45P97390 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps45P97390 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps45P97390 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps45P97390 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps45P97390 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps45P97390 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps45P97390 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps45P97390 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps45P97390 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps45P97390 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps45P97390 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps45P97390 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps45P97390 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps45P97390 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps45P97390 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps45P97390 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps45P97390 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps45P97390 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps45P97390 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps45P97390 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps45P97390 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms