Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Vgll3P85442 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vgll3P85442 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vgll3P85442 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vgll3P85442 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vgll3P85442 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vgll3P85442 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vgll3P85442 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vgll3P85442 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vgll3P85442 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vgll3P85442 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vgll3P85442 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms