Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIM1P81133 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIM1P81133 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIM1P81133 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIM1P81133 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIM1P81133 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIM1P81133 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIM1P81133 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIM1P81133 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIM1P81133 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIM1P81133 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIM1P81133 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIM1P81133 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIM1P81133 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIM1P81133 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIM1P81133 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIM1P81133 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIM1P81133 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIM1P81133 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIM1P81133 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIM1P81133 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIM1P81133 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIM1P81133 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIM1P81133 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIM1P81133 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIM1P81133 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIM1P81133 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIM1P81133 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIM1P81133 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIM1P81133 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIM1P81133 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIM1P81133 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIM1P81133 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIM1P81133 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIM1P81133 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SIM1P81133 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIM1P81133 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIM1P81133 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIM1P81133 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIM1P81133 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIM1P81133 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SIM1P81133 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SIM1P81133 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIM1P81133 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIM1P81133 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIM1P81133 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIM1P81133 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIM1P81133 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIM1P81133 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIM1P81133 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIM1P81133 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIM1P81133 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIM1P81133 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIM1P81133 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIM1P81133 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIM1P81133 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIM1P81133 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIM1P81133 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIM1P81133 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIM1P81133 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SIM1P81133 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIM1P81133 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIM1P81133 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIM1P81133 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIM1P81133 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIM1P81133 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIM1P81133 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIM1P81133 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIM1P81133 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIM1P81133 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIM1P81133 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIM1P81133 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIM1P81133 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIM1P81133 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIM1P81133 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIM1P81133 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIM1P81133 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIM1P81133 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIM1P81133 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIM1P81133 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIM1P81133 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIM1P81133 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIM1P81133 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIM1P81133 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIM1P81133 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIM1P81133 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIM1P81133 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIM1P81133 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIM1P81133 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIM1P81133 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SIM1P81133 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIM1P81133 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIM1P81133 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SIM1P81133 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SIM1P81133 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIM1P81133 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIM1P81133 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIM1P81133 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIM1P81133 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIM1P81133 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms