Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gabpb2P81069 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gabpb2P81069 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gabpb2P81069 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gabpb2P81069 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gabpb2P81069 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gabpb2P81069 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gabpb2P81069 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gabpb2P81069 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gabpb2P81069 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gabpb2P81069 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gabpb2P81069 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gabpb2P81069 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gabpb2P81069 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gabpb2P81069 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gabpb2P81069 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gabpb2P81069 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gabpb2P81069 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gabpb2P81069 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gabpb2P81069 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gabpb2P81069 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gabpb2P81069 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gabpb2P81069 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gabpb2P81069 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gabpb2P81069 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gabpb2P81069 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms