Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx1P81068 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx1P81068 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx1P81068 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx1P81068 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx1P81068 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx1P81068 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx1P81068 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx1P81068 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx1P81068 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx1P81068 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Irx1P81068 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx1P81068 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx1P81068 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx1P81068 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx1P81068 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx1P81068 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx1P81068 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx1P81068 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx1P81068 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx1P81068 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx1P81068 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx1P81068 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx1P81068 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx1P81068 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx1P81068 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms