Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx2P81066 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx2P81066 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx2P81066 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx2P81066 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx2P81066 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx2P81066 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx2P81066 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx2P81066 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx2P81066 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx2P81066 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx2P81066 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx2P81066 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx2P81066 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx2P81066 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx2P81066 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx2P81066 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irx2P81066 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx2P81066 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx2P81066 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx2P81066 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx2P81066 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx2P81066 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx2P81066 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx2P81066 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx2P81066 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx2P81066 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx2P81066 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx2P81066 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx2P81066 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx2P81066 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx2P81066 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms