Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFI35P80217 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFI35P80217 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFI35P80217 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFI35P80217 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFI35P80217 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFI35P80217 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFI35P80217 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFI35P80217 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFI35P80217 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFI35P80217 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFI35P80217 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IFI35P80217 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFI35P80217 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFI35P80217 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFI35P80217 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFI35P80217 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFI35P80217 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFI35P80217 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFI35P80217 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFI35P80217 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFI35P80217 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFI35P80217 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFI35P80217 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFI35P80217 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFI35P80217 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFI35P80217 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFI35P80217 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFI35P80217 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFI35P80217 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFI35P80217 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFI35P80217 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFI35P80217 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFI35P80217 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFI35P80217 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFI35P80217 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFI35P80217 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFI35P80217 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFI35P80217 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFI35P80217 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFI35P80217 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFI35P80217 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IFI35P80217 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IFI35P80217 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFI35P80217 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFI35P80217 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFI35P80217 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFI35P80217 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFI35P80217 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFI35P80217 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFI35P80217 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFI35P80217 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFI35P80217 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFI35P80217 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
IFI35P80217 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFI35P80217 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
IFI35P80217 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFI35P80217 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFI35P80217 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFI35P80217 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFI35P80217 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFI35P80217 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFI35P80217 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFI35P80217 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IFI35P80217 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFI35P80217 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFI35P80217 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFI35P80217 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFI35P80217 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFI35P80217 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFI35P80217 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFI35P80217 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFI35P80217 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFI35P80217 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
IFI35P80217 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFI35P80217 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFI35P80217 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFI35P80217 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFI35P80217 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFI35P80217 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
IFI35P80217 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFI35P80217 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFI35P80217 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFI35P80217 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFI35P80217 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFI35P80217 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFI35P80217 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFI35P80217 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFI35P80217 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFI35P80217 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFI35P80217 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFI35P80217 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFI35P80217 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFI35P80217 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFI35P80217 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFI35P80217 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFI35P80217 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFI35P80217 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFI35P80217 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFI35P80217 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms