Protein–RNA interactions for Protein: P79483

HLA-DRB3, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB3P79483 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DRB3P79483 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DRB3P79483 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DRB3P79483 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DRB3P79483 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DRB3P79483 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DRB3P79483 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DRB3P79483 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DRB3P79483 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DRB3P79483 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DRB3P79483 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DRB3P79483 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DRB3P79483 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DRB3P79483 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DRB3P79483 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DRB3P79483 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms