Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms