Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2P78314 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2P78314 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2P78314 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms