Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tp53bp1P70399 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tp53bp1P70399 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tp53bp1P70399 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tp53bp1P70399 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tp53bp1P70399 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tp53bp1P70399 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tp53bp1P70399 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tp53bp1P70399 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tp53bp1P70399 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tp53bp1P70399 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tp53bp1P70399 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tp53bp1P70399 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tp53bp1P70399 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53bp1P70399 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tp53bp1P70399 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tp53bp1P70399 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tp53bp1P70399 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tp53bp1P70399 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tp53bp1P70399 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tp53bp1P70399 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tp53bp1P70399 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tp53bp1P70399 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tp53bp1P70399 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tp53bp1P70399 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tp53bp1P70399 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tp53bp1P70399 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tp53bp1P70399 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tp53bp1P70399 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tp53bp1P70399 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tp53bp1P70399 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tp53bp1P70399 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tp53bp1P70399 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tp53bp1P70399 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tp53bp1P70399 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tp53bp1P70399 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tp53bp1P70399 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tp53bp1P70399 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tp53bp1P70399 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tp53bp1P70399 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms