Protein–RNA interactions for Protein: P70213

Fv1, Friend virus susceptibility protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv1P70213 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fv1P70213 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fv1P70213 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fv1P70213 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fv1P70213 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fv1P70213 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fv1P70213 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fv1P70213 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fv1P70213 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fv1P70213 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fv1P70213 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fv1P70213 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fv1P70213 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fv1P70213 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fv1P70213 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fv1P70213 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fv1P70213 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fv1P70213 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fv1P70213 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fv1P70213 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fv1P70213 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fv1P70213 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fv1P70213 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fv1P70213 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fv1P70213 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fv1P70213 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fv1P70213 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fv1P70213 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fv1P70213 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fv1P70213 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms