Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SbdsP70122 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SbdsP70122 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SbdsP70122 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SbdsP70122 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SbdsP70122 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SbdsP70122 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SbdsP70122 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SbdsP70122 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SbdsP70122 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SbdsP70122 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SbdsP70122 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SbdsP70122 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SbdsP70122 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SbdsP70122 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SbdsP70122 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SbdsP70122 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SbdsP70122 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SbdsP70122 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SbdsP70122 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SbdsP70122 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SbdsP70122 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SbdsP70122 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SbdsP70122 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SbdsP70122 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SbdsP70122 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SbdsP70122 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SbdsP70122 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SbdsP70122 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SbdsP70122 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SbdsP70122 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SbdsP70122 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SbdsP70122 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SbdsP70122 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms