Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkacbP68181 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrkacbP68181 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkacbP68181 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkacbP68181 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkacbP68181 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkacbP68181 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrkacbP68181 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkacbP68181 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkacbP68181 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkacbP68181 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkacbP68181 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkacbP68181 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkacbP68181 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms