Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTC1P68032 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTC1P68032 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTC1P68032 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTC1P68032 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTC1P68032 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTC1P68032 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTC1P68032 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTC1P68032 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTC1P68032 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTC1P68032 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTC1P68032 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTC1P68032 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTC1P68032 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTC1P68032 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTC1P68032 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTC1P68032 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTC1P68032 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTC1P68032 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms