Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tra2bP62996 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tra2bP62996 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tra2bP62996 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tra2bP62996 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tra2bP62996 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms