Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRA2BP62995 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRA2BP62995 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRA2BP62995 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRA2BP62995 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRA2BP62995 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRA2BP62995 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRA2BP62995 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRA2BP62995 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRA2BP62995 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRA2BP62995 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRA2BP62995 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.4 ms