Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBX1P62877 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBX1P62877 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBX1P62877 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBX1P62877 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBX1P62877 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBX1P62877 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBX1P62877 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBX1P62877 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBX1P62877 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBX1P62877 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBX1P62877 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBX1P62877 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBX1P62877 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBX1P62877 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBX1P62877 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBX1P62877 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBX1P62877 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBX1P62877 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RBX1P62877 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBX1P62877 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RBX1P62877 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBX1P62877 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBX1P62877 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBX1P62877 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBX1P62877 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBX1P62877 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBX1P62877 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBX1P62877 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBX1P62877 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBX1P62877 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBX1P62877 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBX1P62877 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBX1P62877 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBX1P62877 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBX1P62877 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RBX1P62877 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBX1P62877 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBX1P62877 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBX1P62877 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBX1P62877 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBX1P62877 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBX1P62877 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBX1P62877 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBX1P62877 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBX1P62877 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBX1P62877 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBX1P62877 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBX1P62877 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBX1P62877 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBX1P62877 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBX1P62877 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBX1P62877 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBX1P62877 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBX1P62877 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBX1P62877 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBX1P62877 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBX1P62877 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBX1P62877 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBX1P62877 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBX1P62877 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBX1P62877 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBX1P62877 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBX1P62877 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBX1P62877 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBX1P62877 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBX1P62877 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBX1P62877 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBX1P62877 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBX1P62877 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBX1P62877 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBX1P62877 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBX1P62877 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBX1P62877 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBX1P62877 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBX1P62877 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBX1P62877 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBX1P62877 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBX1P62877 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBX1P62877 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBX1P62877 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBX1P62877 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBX1P62877 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBX1P62877 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBX1P62877 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBX1P62877 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBX1P62877 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBX1P62877 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBX1P62877 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBX1P62877 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBX1P62877 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBX1P62877 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBX1P62877 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBX1P62877 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBX1P62877 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RBX1P62877 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBX1P62877 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBX1P62877 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBX1P62877 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBX1P62877 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms