Protein–RNA interactions for Protein: P62312

LSM6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM6P62312 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM6P62312 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM6P62312 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM6P62312 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM6P62312 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM6P62312 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM6P62312 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM6P62312 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM6P62312 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM6P62312 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM6P62312 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM6P62312 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM6P62312 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM6P62312 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM6P62312 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM6P62312 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM6P62312 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM6P62312 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM6P62312 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM6P62312 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM6P62312 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM6P62312 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM6P62312 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM6P62312 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM6P62312 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM6P62312 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM6P62312 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM6P62312 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM6P62312 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM6P62312 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM6P62312 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM6P62312 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM6P62312 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM6P62312 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM6P62312 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM6P62312 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM6P62312 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LSM6P62312 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LSM6P62312 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM6P62312 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM6P62312 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM6P62312 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM6P62312 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM6P62312 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM6P62312 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM6P62312 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM6P62312 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM6P62312 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM6P62312 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM6P62312 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM6P62312 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM6P62312 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM6P62312 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM6P62312 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM6P62312 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM6P62312 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM6P62312 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSM6P62312 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM6P62312 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM6P62312 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM6P62312 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM6P62312 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM6P62312 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM6P62312 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM6P62312 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM6P62312 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM6P62312 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM6P62312 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM6P62312 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM6P62312 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM6P62312 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM6P62312 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM6P62312 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM6P62312 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM6P62312 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM6P62312 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM6P62312 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM6P62312 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM6P62312 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM6P62312 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM6P62312 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM6P62312 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM6P62312 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM6P62312 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM6P62312 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM6P62312 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM6P62312 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM6P62312 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM6P62312 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM6P62312 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM6P62312 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM6P62312 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM6P62312 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM6P62312 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM6P62312 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM6P62312 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM6P62312 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM6P62312 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM6P62312 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM6P62312 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms