Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SnrpfP62307 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SnrpfP62307 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SnrpfP62307 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SnrpfP62307 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SnrpfP62307 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SnrpfP62307 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SnrpfP62307 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrpfP62307 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SnrpfP62307 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SnrpfP62307 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SnrpfP62307 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SnrpfP62307 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SnrpfP62307 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SnrpfP62307 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SnrpfP62307 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SnrpfP62307 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SnrpfP62307 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SnrpfP62307 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SnrpfP62307 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SnrpfP62307 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrpfP62307 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SnrpfP62307 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SnrpfP62307 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms