Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrch1P62046 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrch1P62046 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lrch1P62046 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrch1P62046 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrch1P62046 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrch1P62046 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrch1P62046 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrch1P62046 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrch1P62046 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrch1P62046 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrch1P62046 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrch1P62046 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrch1P62046 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrch1P62046 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrch1P62046 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrch1P62046 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrch1P62046 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrch1P62046 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrch1P62046 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrch1P62046 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrch1P62046 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrch1P62046 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrch1P62046 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrch1P62046 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrch1P62046 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrch1P62046 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrch1P62046 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrch1P62046 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrch1P62046 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrch1P62046 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrch1P62046 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrch1P62046 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrch1P62046 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms