Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copz1P61924 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copz1P61924 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copz1P61924 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Copz1P61924 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copz1P61924 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copz1P61924 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copz1P61924 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copz1P61924 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copz1P61924 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copz1P61924 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Copz1P61924 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copz1P61924 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copz1P61924 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Copz1P61924 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Copz1P61924 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copz1P61924 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copz1P61924 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copz1P61924 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Copz1P61924 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms