Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME3P61289 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME3P61289 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME3P61289 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME3P61289 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME3P61289 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME3P61289 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME3P61289 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME3P61289 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME3P61289 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME3P61289 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME3P61289 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME3P61289 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME3P61289 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME3P61289 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME3P61289 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME3P61289 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME3P61289 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME3P61289 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME3P61289 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME3P61289 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME3P61289 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME3P61289 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME3P61289 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME3P61289 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME3P61289 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME3P61289 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME3P61289 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME3P61289 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME3P61289 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME3P61289 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME3P61289 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME3P61289 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME3P61289 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME3P61289 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME3P61289 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME3P61289 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME3P61289 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME3P61289 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME3P61289 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME3P61289 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME3P61289 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME3P61289 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME3P61289 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME3P61289 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME3P61289 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME3P61289 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME3P61289 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME3P61289 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME3P61289 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME3P61289 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME3P61289 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME3P61289 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME3P61289 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME3P61289 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME3P61289 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME3P61289 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME3P61289 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME3P61289 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME3P61289 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME3P61289 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME3P61289 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME3P61289 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME3P61289 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME3P61289 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME3P61289 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME3P61289 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME3P61289 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME3P61289 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME3P61289 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME3P61289 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME3P61289 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME3P61289 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME3P61289 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME3P61289 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME3P61289 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME3P61289 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME3P61289 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME3P61289 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME3P61289 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME3P61289 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME3P61289 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME3P61289 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME3P61289 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME3P61289 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME3P61289 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME3P61289 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME3P61289 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME3P61289 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME3P61289 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME3P61289 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME3P61289 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME3P61289 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME3P61289 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME3P61289 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME3P61289 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME3P61289 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME3P61289 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME3P61289 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME3P61289 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms