Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR4P61073 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR4P61073 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CXCR4P61073 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms