Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PlnP61014 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PlnP61014 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PlnP61014 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PlnP61014 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PlnP61014 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PlnP61014 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PlnP61014 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PlnP61014 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PlnP61014 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PlnP61014 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PlnP61014 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PlnP61014 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PlnP61014 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PlnP61014 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PlnP61014 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PlnP61014 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PlnP61014 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PlnP61014 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PlnP61014 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PlnP61014 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PlnP61014 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PlnP61014 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PlnP61014 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PlnP61014 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PlnP61014 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PlnP61014 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PlnP61014 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PlnP61014 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PlnP61014 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PlnP61014 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PlnP61014 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PlnP61014 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PlnP61014 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PlnP61014 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PlnP61014 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PlnP61014 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PlnP61014 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PlnP61014 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PlnP61014 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PlnP61014 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PlnP61014 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PlnP61014 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PlnP61014 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PlnP61014 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PlnP61014 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PlnP61014 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PlnP61014 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PlnP61014 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PlnP61014 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PlnP61014 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PlnP61014 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PlnP61014 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PlnP61014 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PlnP61014 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PlnP61014 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PlnP61014 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PlnP61014 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PlnP61014 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PlnP61014 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PlnP61014 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PlnP61014 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PlnP61014 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PlnP61014 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PlnP61014 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PlnP61014 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PlnP61014 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PlnP61014 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PlnP61014 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PlnP61014 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PlnP61014 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PlnP61014 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PlnP61014 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PlnP61014 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PlnP61014 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PlnP61014 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PlnP61014 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PlnP61014 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PlnP61014 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PlnP61014 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PlnP61014 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PlnP61014 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PlnP61014 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PlnP61014 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PlnP61014 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PlnP61014 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PlnP61014 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PlnP61014 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PlnP61014 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PlnP61014 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PlnP61014 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PlnP61014 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PlnP61014 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PlnP61014 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PlnP61014 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PlnP61014 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PlnP61014 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PlnP61014 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PlnP61014 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PlnP61014 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms