Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMFBP60983 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMFBP60983 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMFBP60983 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMFBP60983 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMFBP60983 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMFBP60983 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMFBP60983 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMFBP60983 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GMFBP60983 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMFBP60983 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMFBP60983 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMFBP60983 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMFBP60983 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMFBP60983 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMFBP60983 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GMFBP60983 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMFBP60983 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMFBP60983 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMFBP60983 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMFBP60983 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMFBP60983 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMFBP60983 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMFBP60983 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMFBP60983 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GMFBP60983 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMFBP60983 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMFBP60983 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMFBP60983 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GMFBP60983 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMFBP60983 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMFBP60983 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMFBP60983 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMFBP60983 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMFBP60983 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMFBP60983 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMFBP60983 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMFBP60983 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMFBP60983 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMFBP60983 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMFBP60983 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMFBP60983 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GMFBP60983 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GMFBP60983 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMFBP60983 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMFBP60983 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMFBP60983 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMFBP60983 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMFBP60983 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMFBP60983 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMFBP60983 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMFBP60983 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMFBP60983 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMFBP60983 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMFBP60983 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMFBP60983 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMFBP60983 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMFBP60983 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMFBP60983 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMFBP60983 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMFBP60983 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMFBP60983 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMFBP60983 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMFBP60983 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMFBP60983 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMFBP60983 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMFBP60983 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMFBP60983 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMFBP60983 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMFBP60983 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMFBP60983 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMFBP60983 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GMFBP60983 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMFBP60983 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMFBP60983 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMFBP60983 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMFBP60983 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMFBP60983 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMFBP60983 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMFBP60983 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMFBP60983 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMFBP60983 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMFBP60983 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMFBP60983 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMFBP60983 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMFBP60983 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GMFBP60983 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMFBP60983 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GMFBP60983 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMFBP60983 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMFBP60983 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMFBP60983 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMFBP60983 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMFBP60983 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMFBP60983 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMFBP60983 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMFBP60983 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMFBP60983 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMFBP60983 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GMFBP60983 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.2 ms