Protein–RNA interactions for Protein: P60521

Gabarapl2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabarapl2P60521 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabarapl2P60521 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabarapl2P60521 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabarapl2P60521 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabarapl2P60521 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabarapl2P60521 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabarapl2P60521 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabarapl2P60521 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabarapl2P60521 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabarapl2P60521 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabarapl2P60521 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabarapl2P60521 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabarapl2P60521 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabarapl2P60521 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabarapl2P60521 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabarapl2P60521 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabarapl2P60521 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabarapl2P60521 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabarapl2P60521 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms