Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFRD-1P60508 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ERVFRD-1P60508 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVFRD-1P60508 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms