Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCCD1P59942 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCCD1P59942 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MCCD1P59942 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCCD1P59942 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCCD1P59942 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms