Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nphp4P59240 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nphp4P59240 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nphp4P59240 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nphp4P59240 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Nphp4P59240 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nphp4P59240 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nphp4P59240 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nphp4P59240 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Nphp4P59240 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nphp4P59240 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nphp4P59240 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Nphp4P59240 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Nphp4P59240 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Nphp4P59240 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Nphp4P59240 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Nphp4P59240 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nphp4P59240 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nphp4P59240 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nphp4P59240 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Nphp4P59240 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Nphp4P59240 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Nphp4P59240 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Nphp4P59240 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Nphp4P59240 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Nphp4P59240 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Nphp4P59240 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nphp4P59240 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nphp4P59240 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nphp4P59240 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nphp4P59240 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Nphp4P59240 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Nphp4P59240 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Nphp4P59240 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Nphp4P59240 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Nphp4P59240 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Nphp4P59240 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Nphp4P59240 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Nphp4P59240 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Nphp4P59240 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Nphp4P59240 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Nphp4P59240 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Nphp4P59240 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Nphp4P59240 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Nphp4P59240 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Nphp4P59240 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Nphp4P59240 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nphp4P59240 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nphp4P59240 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nphp4P59240 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Nphp4P59240 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Nphp4P59240 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nphp4P59240 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Nphp4P59240 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Nphp4P59240 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Nphp4P59240 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Nphp4P59240 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Nphp4P59240 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Nphp4P59240 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Nphp4P59240 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Nphp4P59240 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nphp4P59240 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Nphp4P59240 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Nphp4P59240 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Nphp4P59240 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nphp4P59240 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Nphp4P59240 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nphp4P59240 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nphp4P59240 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nphp4P59240 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nphp4P59240 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nphp4P59240 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nphp4P59240 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nphp4P59240 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms